竞争作用
枯草芽孢杆菌的竞争作用主要包括营养竞争和空间位点竞争两个方面。枯草芽孢杆菌在空间位点竞争上占更多优势，即在动物组织表面或植物体内及植物生长的土壤中快速、大量繁衍和定植，有效地阻止病原微生物的繁殖，干扰植物病原微生物对植物侵染，破坏病原微生物在植物上的定殖，从而达到抑菌控病效果。 [1]
溶菌作用
枯草芽孢杆菌可以吸附在病原真菌的菌丝上，伴随菌丝共同生长，生长过程中会产生溶菌物质，从而消解菌丝体。一般会致使菌丝断裂、解体或细胞质消解；或者是次生代谢产物会溶解病原菌孢子的细胞壁，导致细胞壁穿孔、产生畸形等。
产生抗菌物质
产生能够抑制细菌、病毒、真菌和病原体的生长的抗生素类物质，这些抗菌物质以磷脂类、氨基糖类、肽类和脂肽类等抗生素为主。其中，脂肽类抗生素是枯草芽孢杆菌最重要的抗菌物质。 [1]
生物夺氧
枯草芽孢杆菌为革兰氏阳性需氧菌，其能够迅速消耗动物体肠道内的游离氧，从而有效提高营养物质的利用效率。枯草芽孢杆菌还能够分泌淀粉酶、脂肪酶、蛋白酶、和纤维素酶等多种内源酶，为动物提供大量的内源酶，在一定程度上能弥补动物体内内源酶的不足。